Nemo es un pez payaso al que por un accidente le falta una aleta y no puede nadar bien. El primer día de cole, jugando con sus amigos, se arriesga a suber a la superficie. Un buceador lo 'pescará' y se lo llevará a la ciudad (Sydney). Comienza así la aventura de su padre Marlin, y la loca Dory, que le buscan desesperadamente a través del océano.
Mientras, Nemo está encarcelado en la pecera de la consulta de un dentista. Allí conocerá a otros residentes capturados